Etude in silico d'amorces de pcr

Détermination de la spécificité et de la couverture des amorces pcr pour l'identification de pathogè

Julien Gardès - Collection Omn.univ.europ.

124 pages, parution le 12/03/2012

Ajouter à une liste

Expédié sous 9 jours

Livraison à partir de 0,01€ dès 35€ d'achats
Pour une livraison en France métropolitaine

QUANTITÉ

Résumé

Avec l'avènement des technologies basées sur l'ADN, les méthodes moléculaires de détection bactérienne (e.g. la Polymerase Chain Reaction (PCR)) sont progressivement en train de remplacer les méthodes de détection traditionnelles basées sur la culture cellulaire et la caractérisation biochimique de souches. Les amorces de PCR sont des petites séquences d'ADN qui vont permettre de cibler une région génétique à amplifier. La nature de leur séquence va donc conditionner la spécificité et la couverture (ou sensibilité) de la détection par PCR. Au cours de ma thèse, je me suis intéressé aux amorces de PCR qui ont été publiées dans la littérature scientifique. J'ai élaboré plusieurs procédures automatisées (pipelines) de bioinformatique pour (1) rechercher toutes les séquences d'un gène, (2) tous les articles scientifiques qui traitent de ce gène, (3) toutes les amorces PCR issues de cette littérature, et (4) vérifier leur efficacité, i.e. leur spécificité et leur couverture vis à vis de l'espèce bactérienne ciblée. Le site internet http://patho-genes.org regroupe tous les résultats et le logiciel (Oligomer-Extractor) qui ont été développés au cours de mes travaux.

Caractéristiques techniques

	PAPIER
Éditeur(s)	Editions universitaires européennes
Auteur(s)	Julien Gardès
Collection	Omn.univ.europ.
Parution	12/03/2012
Nb. de pages	124
Format	15 x 22
Couverture	Broché
Poids	194g
EAN13	9786131535314